La bibliothèque de recherche du CEDEJ comprend : 35 119 volumes (aux deux-tiers en arabe); 6500 cartes; 5000 publications statistiques égyptiennes.
Après un audit et sa réinstallation en 2016 dans les locaux de Garden City, le fonds a fait l’objet d’une action de récolement en 2017, puis d’un comptage manuel. La numérisation d’une partie du fonds documentaire a démarré en 2018 supervisée par le Pôle Humanités numériques, en partenariat avec la Bibliotheca Alexandrina. Un projet de re-catalogage du fonds bibliothécaire sous le format MARC 21 a également été entrepris.